Основными направлениями деятельности МПЦ являются:

• содействие развитию демократических процессов, построению гражданского общества и правового государства, внедрению и развитию института медиации в Казахстане;
• оказание юридической, психологической и медиативной помощи;
• обучение профессиональных медиаторов, ведение их реестра;
• разработка проектов и программ по вопросам защиты прав человека, развития медиации и снижения уровня конфликтности в обществе; проведение мониторинга и анализа по вопросам соблюдения прав человека;
• расширение и укрепление международных связей по правовым и медиативным вопросам.